Det framgår inte om Son missar VM som inleds i Qatar om tre veckor.
Son Heung-Min leddes av planen i tisdagskvällens 2–1-seger i Champions League mot Marseille på Stade Vélodrome.
Sydkoreanen såg omtöcknad ut och det visade sig snart att han drabbats av en fraktur vid vänster öga.
Tottenham meddelar att anfallaren så snart det går börjar sin rehabilitering efter operationen. När han kan spela fotboll igen uppges inte.
Sydkorea spelar i samma grupp i VM som Uruguay, Ghana och Portugal och spelar sin första match mot Uruguay den 24 november.