Efter 0–1 borta mot bottenkonkurrenten Bielefeld stod det klart att Schalke åker ur tyska högstadivisionen för första gången på 32 år. När laget kom tillbaka till Schalkes hemmaarena tidigt på onsdagen möttes de av äggkastning och verbala attacker, säger polisen.
Supportrar hade redan börjar tända fyrverkerier och bengaler omkring stadion direkt efter förlusten.
"När laget sedan anlände och steg av bussen var där ordentliga protester", skriver polisen i ett uttalande.
Klubben hade planerat att möta omkring 500 supportrar för att diskutera situationen.
"Under mötets gång gick ett antal oidentifierade över gränser som är inte är förhandlingsbara för FC Schalke 04", skriver klubben på sin hemsida.
"Även om vi förstår frustrationen och ilskan på grund av nedflyttningen till Bundesliga 2, så kan klubben aldrig acceptera att våra spelare och ledare hotas att skadas fysiskt".
Schalke har haft fem olika tränare under säsongens gång och ligger klart sist i tabellen.