I ett brev till USA:s biskopar skriver påven att det myndighetsprogram som utvisar utvisra människor enbart för att de vistas i landet olagligt berövar migranter "deras nedärvda värdighet" och kommer att sluta illa, rapporterar AP och AFP.
Länder har rätt att försvara sig från kriminella, men att utvisa människor som i många fall lämnat sina hemländer för att komma ifrån extremfattigdom, osäkerhet, exploatering, förföljelse eller allvarlig miljöförstörelse gör dem ännu mer sårbara och försvarslösa, skriver påven.
Argentinskfödde Franciskus är den förste latinamerikanske påven. Han talar ofta om behovet av att skydda migranter och flyktingar och om klimatet.
Donald Trumps ansvarige för de aviserade utvisningarna av miljontals papperslösa, Tom Homan, svarar med att påven borde sköta sitt.
– Jag önskar att han höll sig till den katolska kyrkan och lämnar gränskontrollerna till oss, säger den så kallade "gränstsaren" i Vita huset.