Åtminstone två av dem skadades allvarligt men enligt en polistalesperson är det ingen som har livshotande skador, skriver Süddeutsche Zeitung.
Angreppet skedde på sträckan mellan städerna Regensburg och Nürnberg.
En 27-årig man har gripits misstänkt för attacken. Motivet till dådet är okänt. Enligt medieuppgifter gav mannen ett förvirrat intryck.
Uppemot 300 passagerare befann sig ombord på tåget, som evakuerades i samband med en större polisinsats.
"Den här knivattacken är fruktansvärd", skriver Tysklands inrikesminister Horst Seehofer på Twitter.
Han tackar polisen och tågpersonalen för deras ingripande.
"Motivet till det här brottet är fortfarande oklart och kommer att utredas", skriver Seehofer vidare.