Uppgiften kommer från biträdande hälsoministern i Kirgizistan, som på fredagen preciserade antalet till 31 döda och över 150 skadade sedan våldsamheterna bröt ut på torsdagen.
Gränsstriderna var de mest intensiva på flera år.
Ryska Interfax rapporterade att eldstrider bröt ut på nytt natten till fredagen vid en gränsövergång i regionen Batken.