De tre deltog i en religiös festival och försökte där förmå människor att konvertera till kristendom. Händelsen ska ha inträffat i regionen Naharkatiya i delstaten Assam enligt myndigheter.
De tre får betala motsvarande omkring 5 000 kronor vardera i böter och har tagits till Delhis internationella flygplats Indira Gandhi, för att flygas tillbaka till Sverige under fredagen.
Regionala medier rapporterar att de tre tillhör den amerikanska församlingen United Churches Fellowship och nätverket Bless Assam Mission Network.
India Today rapporterar att missioneringen genomfördes i Nakarkatia denna vecka, och att de tre fördes till en lokal domstol där det konstaterades att de brutit mot visumregler.
UD:s pressjour har inte bekräftat utvisningen.